La historia de la Facultad de Medicina de la Universidad Finis Terrae comienza en 2001, con su creación bajo el liderazgo del Dr. Santiago Soto, quien asumió como su primer decano, siendo este el punto de partida de un proyecto educativo que buscaba formar profesionales médicos de excelencia. Un año después, en 2002, se dio inicio oficial a las actividades académicas con el ingreso de la primera generación de estudiantes a la carrera de Medicina, marcando un momento clave en la consolidación de la Facultad.

En 2009, el Dr. Alberto Dougnac asumió como decano, liderando a la Escuela de Medicina hacia su primera acreditación con la Comisión Nacional de Acreditación (CNA) por un año. Este logro representó un importante paso en el camino hacia el reconocimiento de la calidad educativa.

Al año siguiente, en 2010, Medicina obtuvo su segunda acreditación, esta vez por un período de cuatro años, consolidando su posición en el ámbito académico. Además, la Facultad logró incorporarse a la Asociación de Facultades de Medicina de Chile (ASOFAMECH), fortaleciendo su presencia en el contexto nacional.

El 2012 trajo consigo un nuevo equipo directivo. El Dr. Luis Maldonado asumió como Director de Escuela, mientras que el Dr. Ernesto Vega fue nombrado Director de Carrera, reforzando el liderazgo estratégico de la Facultad. Dos años después, en 2014, se inició un hito significativo con la creación de programas de especialidades médicas, ampliando la oferta académica y posicionando a la Facultad como un referente en la formación de médicos especialistas.

En 2015, la carrera de Medicina alcanzó su tercera acreditación con CNA, esta vez por un período de cinco años, lo que evidenció el avance constante en los estándares académicos y el compromiso con la calidad educativa. Este crecimiento continuó en 2019, un año marcado por la obtención de la cuarta acreditación, logrando el reconocimiento por seis años, un logro que destacó el desarrollo sostenido de la Facultad. Ese mismo año, se renovó el equipo directivo, con el Dr. Ernesto Vega como Director de Escuela, la Dra. Verónica Galleguillos como Directora de Carrera y la E.U. Marcela Salazar como Directora de Vinculación con el Medio y Campos Clínicos.

En 2021, la Dra. Cristina Pool asumió como Directora de Carrera, aportando su experiencia y liderazgo al fortalecimiento de los programas académicos. Dos años después, en 2023, se produjo una nueva transición con el nombramiento del Dr. Ernesto Vega como decano de la Facultad y del Dr. Marco Reyes como Director de Escuela, marcando el inicio de una etapa renovada.

Finalmente, en 2024, se incorporaron nuevos liderazgos con la llegada de la Dra. Rosario Fernández como Directora de Carrera, reafirmando el compromiso de la Facultad con la formación de excelencia y la mejora continua.